但这位德国队长的切尔西首秀却没有留下美好的回忆。2006年8月13日，社区盾杯，切尔西对阵利物浦，巴拉克首发出场，结果上场26分钟，巴拉克就受伤离场，切尔西最终以1：2落败切尔西几次英超冠军，巴拉克则获得了自己在英格兰的第一个亚军。
2006年8月27日，巴拉克在英超联赛第三轮客场对阵布莱克本的比赛中上演英超首秀；9月9日，在英超第四轮主场对阵查尔顿竞技的比赛中，巴拉克在比赛第6分钟助攻德罗巴破门，这是他在英超联赛中的首次助攻，并帮助球队2:1击败对手。
9月12日，欧冠小组赛首轮切尔西主场对阵不来梅的比赛中，巴拉克在比赛第68分钟通过点球破门，为切尔西攻入个人首粒进球，帮助球队2比0获胜。
9月17日，英超第五轮主场对阵利物浦的比赛中，巴拉克在第52分钟因对西索科严重犯规被红牌罚下，这是他进入英超以来的第一张红牌。所幸切尔西最终以1：0战胜对手。赛后，英足总对巴拉克实施了3场禁赛。
10月21日切尔西几次英超冠军，英超联赛第9轮主场对阵朴茨茅斯的比赛中，停赛复出的巴拉克在比赛第57分钟打入自己英超生涯的首粒进球，帮助球队2:1击败对手。
整个2006/07赛季，巴拉克为切尔西出场46次，攻入7球并贡献6次助攻。巴拉克在球队的第一个赛季也是喜忧参半。切尔西在英超联赛中仅次于曼联获得第二名。巴拉克在蓝军的第一个赛季就获得了两次亚军。他们还被利物浦挡在了欧冠决赛之外。幸运的是，切尔西顺利赢得了足总杯和联赛杯切尔西几次英超冠军，特别是在联赛杯对阵阿森纳的比赛中，巴拉克助攻德罗巴打入扳平比分的一球。
因为脚踝伤势，巴拉克缺席了2007年8月至12月的几乎所有比赛。在此期间，切尔西在社区盾杯中不敌曼联，为巴拉克再添一枚亚军奖杯。巴拉克直到当年12月26日英超联赛第19轮主场对阵阿斯顿维拉的比赛中才复出。本场比赛，巴拉克贡献1个进球和1次助攻，帮助球队4：4战平对手。
切尔西本赛季一团糟，罗森博格追平欧冠后穆里尼奥下课，以色列人格兰特接手球队。巴拉克因伤缺席了不少比赛，但他在赛季末几乎成为切尔西的英雄。2008年4月26日，英超第36轮，主场迎战领头羊曼联，巴拉克梅开二度，帮助切尔西2:1战胜对手，积分追平对手，重燃夺冠希望。
然而奇迹并没有发生，切尔西以2分之差落后曼联，夺得英超联赛亚军。算上联赛杯决赛不敌热刺，这已经是巴拉克本赛季第三次获得亚军。但命运对巴拉克要残酷得多。5月21日，切尔西首次亮相欧冠决赛，对手是曼联。莫斯科雨夜的故事人尽皆知。两队战至点球大战，巴拉克为切尔西主罚第一个点球并破门得分。然而，特里·阿内尔卡未能将点球打进，巴拉克再次无缘大耳朵杯。
如同八年前一样，巴拉克再次斩获多项亚军，但他万万没有想到，残酷的命运远未结束。赛季刚结束，巴拉克便率领德国队征战今年的欧锦赛。德国队开局不错，2：0战胜波兰，但第二轮却0：2不敌克罗地亚，让人不禁怀疑他们是否会遭遇小组赛三连败。关键时刻，巴拉克再次挺身而出，小组赛最后一轮对阵东道主奥地利的比赛中，巴拉克在下半场开始后不久命中最后一球，帮助德国队战胜对手，顺利晋级小组赛。
在对阵葡萄牙的1/4决赛中，巴拉克在第61分钟头球破门，帮助德国队3:2击败对手，挺进半决赛。
在以3:2惊险战胜土耳其后，巴拉克距离欧锦赛冠军仅一步之遥。他们的对手是西班牙，决赛于2008年6月29日举行。然而，比赛第32分钟托雷斯的进球让巴拉克感觉到形势不妙，作为队长的他当然不会轻易放弃，尽管他眉毛被划伤，血洒在场上，但经过简单处理后，他还是继续上场。
可惜老天并没有被巴拉克的坚持感动，西班牙1:0战胜德国夺得最后的冠军，巴拉克只能无奈的再次获得亚军，更让人遗憾的是，这竟然成了德国队长在世锦赛上的最后一首歌。
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